2006년 6월 10일부터 11일까지 2일간 국립중앙과학관에서 사이언스데이가 개최되었다. 이번 사이언스데이는 국립중앙과학관의 요청으로 전국과학교사협회가 30개의 부스를 운영하게 되었다. 전국과학교사협회 사단법인화 이후 처음으로 수행하게 된 사업이었다. 전과협은 이번 행사를 진행하면서 유료부스의 운영없는 것을 전제로 하였으며 이런 결과로 처음으로 대전지역 연구단지기상청외 여러 연구단체가 참여하는 성과를 이루었다. 서울과 전국각지에서 비가 많이 내렸지만 다행스럽게도 첫 날 행사이후 장대같은 소나기가 내렸을 뿐 행사를 진행하기에는 아주 좋은 날씨였다. 주 5일제 휴일을 맞이하여 많은 사람들이 가족단위로, 연인끼리, 또는 단체 체험활동의 형태로 참여하였다. 이번 부스 운영에는 경과연, 신과람, 과교연, 대전과학교사모임의 지역모임에서 역할 분담을 하였으며 기존의 개방형태의 부스 운영이 아닌 운영본부에서 티켓을 발부하여 부스 운영의 혼잡스러움을 피하려는 시도를 하였는데 이는 참여 학생들이 단순한 만들기의 공작이 아닌 차분한 분위기 속에서 과학적 원리를 배울 수 있는 장을 마련하기 위함이였다.
- 요술거울-대전느리울중학교(최윤주-이소희-유가람)
- 전자기회전목마-한울중학교(전경아)
- 입체별자리 카드만들기-개원중학교(박영희)
- 쾌속전동기만들기-오수고등학교(조영남)
- 조트로프만들기-대전송강중학교(이정경-우성식-최우림-홍은혜-장지선)
- 편광으로만드는멋진세상-숭인중학교(한은주-서동연-이영재-정원빈)
- 팬파이프만들기-진주예술고등학교(박교선)
- 플러버놀이-선부중학교(박소영-전찬웅-곽현-이문곤)
- 폭발하는 비누방울-전주중앙중학교(전병은-강대승-국보승-김정현-최아리나)
- 간이사진기만들기-도봉정보산업고등학교(박지은-김준형-신정호)
- 필름통돌리기-봉은중학교(배예준-추상범-홍성윤)
- 해시계만들기-안산부곡중학교(권정인-황인원-진영식)
- 필름통마그네슘전지-군포정보산업고등학교(박세희-임상빈-오세종-이상민-임재환)
- 헤론의분수-양지중학교(이우재)
- 러브미터만들기-대전진잠중학교(조수민-박민수-정인애)
- 내손가락을화석으로-원곡중학교(양가밀-이연희-유영주)
- 매직플라워만들기-숭문고등학교(배준우-김재원-김준영-김도헌)
- 무지개용액 만들기-성신여자고등학교(박상희-공정윤-박다솜-이강진)
- 물에도피부가있다-월계고등학교(현종오-유승한-허지범-한희섭)
- 미니롤러코스터-마령중학교(최금희-조세운-조세빈-조민주)
- 알코올권총만들기-휘경중학교(양소영-안혜림-이아름)